支橕信息技術發展的科學基礎
重點研究新算法與軟件基礎理論，虛擬計算環境的機理，海量信息處 理及知識挖掘的理論與方法，人機交互理論，網絡安全與可信可控的信息 安全理論等。
重大科學研究計劃
根據世界科學發展趨勢和我國重大戰略需求，選擇能引領未來發展， 對科學和技術發展有很強帶動作用，可促進我國持續創新能力迅速提高， 同時具有優秀創新團隊的研究方向，重點部署四項重大科學研究計劃。這 些方向的突破，可顯著提昇我國的國際競爭力，大力促進可持續發展，實 現重點跨越。
蛋白質研究
蛋白質是较主要的生命活動載體和功能執行者。對蛋白質復雜多樣的 結構功能、相互作用和動態變化的深人研究，將在分子、細胞和生物體等 多個層次上揭示生命現象的本質，是後基因組時代的主要任務。同 時，蛋白質科學研究成果將催生一系列新的生物技術，帶動醫藥、農業和 綠色產業的發展，引領未來生物經濟。因此，蛋白質科學是目前發達國家 激烈爭奪的生命科學制高點。
重點研究重要生物體系的轉錄組學、蛋白質組學、代謗f組學、結構生 物學、蛋白質生物學功能及其相互作用、蛋白質相關的計算生物學與系統 生物學，蛋白質研究的方法學，相關應用基礎研究等。
